麦兜与吉仔自小认识且情谊深厚,一天收到追杀令,要杀掉之人竟然是麦大佬,麦于情义两难下,宁愿挨了吉仔一刀,救回鸡眼标,更背负了背叛之名,与吉仔远走台湾。到了台湾,吉仔仍伺机东山再起,反而麦兜往车行打工,希望过回正常的生活。 而鸡眼标虽然避过吉仔的追杀,却被野心勃勃的大头仔杀死,为免奸计被识破,大头仔决定追到台湾,誓要把吉仔与麦兜置之死地,一场大战,麦兜与吉仔二人并肩杀出围,但已身受重伤,幸好一架神秘货车赶至把二人救走,二人庆幸之际,却原来已堕进台湾著名黑帮唐非的阴谋。。21世纪末,人类的科技水平已高度发达,克隆人技术和宇宙航行早已实现,不再是梦想。与此同时,许多科学家仍孜孜不倦追索着人类起源的秘密与真相。通过对许多古老文明的考察与对比,科学家伊丽莎白·肖和查理·赫洛维发现,人类可能是来自一个遥远星系的外星人创造的。在Weyland公司资助下,他们乘坐维克丝所掌管的宇宙飞船普罗米修斯号前往那颗未知的星球。
经过对当地的考察,地球人的设想成功得到印证。可是他们贸然探查“神的秘密”的行为,也将自己引入万劫不复的深渊……。1958年的一天,身心都布满创痕的安娜•朱林(弗吉妮•莱德因 Virginie Ledoyen 饰)受雇来到法国位于阿尔卑斯山脚下的圣天使孤儿院担任清洁工作,这座孤儿院有着悠久的历史,二战期间曾作为临时的儿童医院接收了三百多名孩子。如今孩子们随着负责人弗兰卡(Catriona MacColl 饰)前往新的所在,古老的圣天使行将废弃,连同它所隐藏的秘密一同淡出历史。 偌大的孤儿院,除了波兰管家海伦娜外,还有一个疯疯癫癫的小女孩朱蒂丝(洛•多琳 Lou Doillon)。她如鬼魅般游走各个房间,身边仿佛站满看不见身影的孩子。安娜不得已卷入其中,渐渐发现了其中的秘密……。