故事发生在1945年2月,一批被关押在泰国坎博里劳工营里的战俘,被日本军方下令,长途转移,押送回日本本土。在运送途中,波折不断,当地游击队的拦截,战俘的逃跑都被无情而残酷地镇压。最终这批战俘,在越南西贡登上货船巴西丸号,由军舰护卫,前往日本。在海上航行的日日夜夜里,战俘们遭受了地狱般的折磨和煎熬。由英军少校本福德和澳籍中校亨特率领,他们忍无可忍奋起反抗,夺下了货船的控制权。而此时,一艘美军潜艇由于不知内情,受上级指令向所有悬挂日本旗帜的船只开火,数枚鱼雷击中货船,战俘们再一次面临巨大的生死考验......。拿威在一次潜水意外与人鱼少女相遇,同时也邂逅了水底摄影师大霈。
擅长自由深潜的拿威担任她的海上向导,这片未开发的海底美景让来自都市的大霈如痴如醉;在大霈镜头中的海洋,更是从小生长在兰屿的拿威看到未曾体验过的宇宙观,他们用彼此的眼看见了全新的世界,也让拿威看见了自由深潜的未来与商机、给了他出走兰屿的契机。
躲在礁石后的人鱼少女,是那次潜水意外中真正救了拿威的人,她奋力的褪去尾鳍、与拿威再次的相遇。她有着纯朴和洁净的心,也有着如海洋般的温暖和静谧,当拿威与人鱼少女悠游在海底深潜,他感受到无比的自在与平静,以及对故乡浓浓的依恋。“来我的怀里当一条鱼吧……”,他仿佛听见了海洋的呼唤、听见了少女的期待。
究竟该投入大海的拥抱,还是追求更大的梦想?
拿威陷入了美美与人鱼少女中的纠结,这是“离开”与“留下”的选择,也是“寻找”与“回归”的选择。这片让人依恋的海,是道路的终点,给予兰屿得以保有纯真与自然的屏障,还是奔向世界的起点?。巴巴·沃斯(杰森·莫玛饰)努力与家人团聚。他疏远的兄弟伊多(戴夫·巴蒂斯塔饰)抓住了巴巴的女儿哈尼瓦,并发誓要报复他的兄弟。与此同时,巴耶王国和特里凡提亚共和国之间的战争威胁迫在眉睫,这将巴巴和他的家人直接拖入了冲突的中心。。