在星奏学院里,学生被分为两类,一类是就读于普通科的平凡学生,另一类是就读于音乐科的能够看见音乐精灵的演奏天才。在一次偶然中,普通科的日野香穗子(高木礼子配音)撞见了音乐精灵莉莉(水桥香织配音)。莉莉赠予了完全不同音律的香穗子一把魔法小提琴,只要和小提琴心意相通,就算是完全没有经验的初学者也可以演奏出美妙的旋律。 凭借着魔法小提琴,香穗子被选中参加了学校的音乐演奏会。这突如其来的新人遭到了许多学生的妒忌和算计,但香穗子也因此结识了一帮热爱音乐的良师益友。冷酷毒舌的月森莲(谷山纪章配音),沉默温柔的志水桂一(福山润配音),开朗率真的土浦梁太郎(伊藤健太郎配音),双重性格的柚木梓马(岸尾大辅配音),在和这些天才们相处的过程中,香穗子发现,自己对于音乐的心意渐渐的发生了变化。。1996年全球陷入奥林匹克的狂热中。田径场上、泳池边等等10种以上的竞技,创下一个接着一个的世界纪录。人人疯狂的传递这些消息、这些创下远超过人类的常识范围的记录的选手,被称赞为「超人类」。这时,没有医生执照的黑杰克的电话录音机里,常常听见既未留下性名也未告知病状的女生留言:请务必与我连络,我会为医生准备好空白支票。我的电话号码是…..
两年后,「超人类」的出现不仅只限于体育界,音乐、绘画、文学、乃至于物理、科学遍布各个领域,持续于日常生活的话题中独占遨头。而这些消息也传到对世事向来漠不关心的怪医黑杰克的耳中。此时,接到从伦敦郊外打来的国际电话。
这名女子叫乔‧凯洛儿。她是圣‧乔爱儿研究中心的主任研究员。她也是那通电话的委托人。乔拜托黑杰克对圣‧乔爱儿研究中心协助帮忙,但总觉得有其中危险四伏的黑杰克断然拒绝了,可是助手贝贝被他们抓去当人质作为要挟,没办法只有妥协接受了。大规模买地的圣‧乔爱儿研究中心收容因不明原因发病的「超人类」的病患。然而,发病的这些人半数以上全都身亡。
之后,聪明的黑杰克便查出了哪里有问题,从病者的症状中,黑杰克有了初步的假设。从脑下垂体分泌的贺尔蒙-被称为脑内麻药,这种贺尔蒙如果大量分泌的话,会完全的增加集中力、发挥高度的能力。这是因基于某种理由被贺尔蒙异常地持续分泌。全世界被认定为「超人类」的共有1230位。
于是,乔‧凯洛儿便买了一甁酒庆祝,但,黑杰克却不知道红酒里,乔‧凯洛儿加了超人类病患的原缩液!。