一个名为“阿卡姆”的民间组织受到远古文明留下的讯息启发而成立。旨在保护及封印超古代文明的危险遗迹。加入“阿卡姆”的特殊工作人员,人们称之为SPRIGGAN。其中实力No.1的特工是一位叫作御神苗优(森久保祥太郎 配音)的十七岁少年。在土耳其的一次调查工作中,“阿卡姆”竟无意地发现了诺亚方舟。方舟隐藏着毁天灭地的神秘力量,于是很多组织都开始窥伺这个传说中的远古遗迹。美国派出了半机械改造人小队与“阿卡姆”展开激烈的遗迹争夺战。而其中一个以神自称的改造人少年竟想私自利用挪亚方舟引发第二次洪水灭世……御神苗优是否能够阻止这一疯狂的计划呢?世界将会走向灭亡吗?。遥远未来,世界人口数在迎来巅峰后,开始呈现下降的趋势。人类为了让物种繁荣存续,制作出管理生态系的AI,并执行「人类多样化实验」。常人、兽人、魔族等经过遗传因子改造诞生的「多样人种」,在环绕高壁的生活圈之中,打造出被称作「CLUSTA」的「多样城镇」。有着丰富人口的「CLUSTA」,在各地都有不同的文化发展以及适合在地生活的人类居住。 为了不面临灭绝,人们都在AI的管理下度日──。。