故事发生在明朝末年,大将军戚继光和兵部尚书戚继宇联手组成戚家军,对胆敢侵犯国土的倭寇迎头痛击。倭寇首领大岛正雄和朝中司礼大太监童大宝(于承惠 饰)内外勾结,陷害戚继宇,导致戚家军解散,戚家遭到了满门抄斩,作为戚家唯一的后代,戚少正(吴京 饰)不得不踏上了逃亡的旅途。
少林寺方丈至一(王珏 饰)将戚少正收为徒弟,童大宝得知了戚少正的下落,火烧少林,至一为了保护戚少正不幸身亡。之后,戚少正带着至一的血书前往南少林投奔圆照方丈(徐向东 饰),并先后结识了小妮(法提麦·雅琦 饰)、红莲和华子等人。血气方刚的一行年轻人,打算凭借他们自己的力量,重建戚家军。。少林哑徒弟(成龙 饰)为了报杀父之仇而学武,从挑水砍柴做起,苦熬内功基础,打出木人巷学成武功的情形时时出现在他的梦中,父亲被害的惨状和客居少林的五枚师太的开解令他在疲乏时咬紧牙关坚持。哑徒弟在少林禁地发现了被锁住的老怪人法愚,法愚不似少林僧人,但有感于哑徒弟的照顾,法愚指点尚不具备学习少林武术资格的哑徒弟武功,期间哑徒弟师兄闯入木人巷却实力不济铩羽而归。五枚师太见独自温习武功的哑徒弟出招狠辣,随传授蛇翼八步调理其心性,经法愚调教,哑徒弟成功打出木人巷,得以学成下山,法愚令其携带信物联络江湖帮派,引发江湖搏杀,而哑徒弟又发现了法愚的真实身份……。