在前三集里,动画片描述了麦兜灰色的成长故事,让观众在欢笑中感受到一丝淡淡的忧伤。这一次,在《麦兜·武当》中,麦兜的故事依然从灰色的幸福开始。暑假,当小朋友都到新西兰滑雪、到北京大学学普通话、到剑桥学英文并顺道看看哈利·波特的时候,家境贫寒的麦兜因为妈妈北上武汉做食肆生意,只好被“暂寄”在武当山的武术学校“太乙春花门”学习太极拳。。经过艰苦鏖战,星矢、紫龙等人终于打败包括三巨头在内的108冥斗士,凭借12黄金圣斗士的力量和沾染女神献血复活的圣衣的加护,星矢等人最终冲过叹息之墙和异次元空间,一辉也在潘多拉的帮助下随后抵达冥王哈迪斯盘踞的所在——极乐净土。
这是一片至高无上的天堂,没有饥饿、战争和痛苦,只有死后被神选中的人才能达到这里。他们的到来惊动了守护哈迪斯的两位神明——死神达拿都斯和睡神休普诺斯。他们的神力极为强大,纵使曾无数次保护过青铜圣斗士的黄金圣衣在他们的面前也薄如脆纸。绝望之际,圣衣的力量再次苏醒,进化成只有神灵才能拥有的神圣衣。神与神的战争再次升级,人类的命运将会如何?。