農曆除夕晚上,青衣帶著兒子大娃等著丈夫石子從萬里以外回來團聚,可惜等了一個晚上音訊全無,兒子更頻頻看到一個青衣看不見的叔叔。隔壁二嬸登門拜訪,青衣拜託二嬸暫時照顧大娃,自己則跑到村委會打電話到工廠了解丈夫下落,豈料得悉工廠發生意外,丈夫生死未卜。那邊廂二嬸在青衣家遇上怪事,急奔到村委會找青衣求救,卻把大娃獨留在家中。青衣馬上回家看到大娃安然無恙,心裏稍定下來,卻發現一陌生男人躲在家中暗角!青衣無路可逃,只能帶著大娃在家中四處躲避。到底這男人是人是鬼,來到青衣家又是所謂何事呢?。1979年,昆仑山发现神秘生物骸骨,由胡八一率领的探险队深入昆仑山腹地,寻找有关古生物遗迹的更多秘密,却不料在这个过程中遭到不同神秘生物的轮番攻击,并意外坠入九层妖塔,除胡八一外,一行人生死成谜。
胡八一退伍后回到北京,重逢了发小王凯旋,并在神秘人与科考队两股力量的夹缝中重新踏上了探寻未知文明的征程,途中与Shirley杨邂逅,熟识的面孔唤醒了他身处探险队那段日子的记忆。此行凶险,在还没来得及搞清楚Shirley的真实身份之际,胡八一、Shirley、王胖子率领一行人便在王子墓、石油小镇等地遭到不明生物的轰炸,这里所发生的一切再度指向九层妖塔,而这次等待他们的,将是一个尘封已千年的未解之谜……。