《闪亮的爸爸第二季》较之第一季更突显的现实教育意义,也成为“闪爸”们即将面临的另一个挑战。本季节目选择留守儿童参与节目录制,旨在通过明星与孩子的相处引导社会正视亲子关系,了解“爱与陪伴”才是教育的本质所在,从而向更多受众传递社会正能量。。魔法学院中海螺长老正在给魔法少年们传授海洋知识,幻化成黑雾的海蛇女王突然侵袭魔法学院,不但抓走了海螺长老,还用利用海螺长老的法器海螺吸干了海水。教官意识到海底世界的危险命令魔法少年前往海底世界救援,魔法少年们来到海底世界后很快发现了异样,并将目标锁定住了海蛇女王,原来海蛇女王是海底垃圾辐射后的变异体,野心勃勃的海蛇女王联合电鳗法师、虾兵蟹将在海底世界胡作非为,并利用“海晶”控制缺水的海底精灵们,企图统治海底世界。魔法少年们分析出事件的真相后与海螺长老、海公主、小涂涂等海底精灵齐心协力,不畏艰险,最终战胜了海蛇女王,夺回了海螺,恢复了海底世界的自由和快乐,经过这次的战役之后魔法少年们也更加深刻的明白了不乱扔垃圾,保护环境的重要性。。