江户时代某町,一下级武士不满上级食言,遂挥刀砍死长官,引起一片混乱。事后,中年武士中村主水(藤田まこと 饰)成为代罪羔羊,遭到降职减薪处罚。不久,年轻俊美的长官奥田右京亮(真田広之 饰)走马上任。与此同时,一群落魄浪人组成的团伙对当地百姓居住地进行大肆骚扰,混乱之中,一老者不幸身亡。偶然闲荡于此的主水事感蹊跷,暗中展开调查。而老者的女儿为给父亲报仇,不惜出卖身体赚钱聘请能杀掉浪人的勇者。在此期间,主水结识了带着两个孩子的浪人文七(千葉真一 饰)。两人不打不相识,主水拜托文七调查右京亮的出身,结果发现这个新任长官和浪人集团有着千丝万缕的联系。
背后的阴谋由此渐渐浮出水面……。江市刑警队特侦组组长童帆通过进修犯罪现场勘查、犯罪心理高级课程,希望为刑侦工作开拓出新的境界,走出一条科技强警科学刑侦的新路,同时还建议引进心理辅导机制,对长期处于高压工作环境、面对穷凶极恶犯罪分子的干警进行心理干预。此时,江市发生了一系列恶性案件,特侦组全面进入侦查,却发现隐藏在凶案背后的一个危害社会安全的大阴谋。在一次次深入案件的调查中,童帆忍受着常人难以承受的压力,带领特侦组成员通过对犯罪心理和犯罪现场的完美还原等科学技术手段,与时俱进办案,拨开重重迷雾,历经艰难险阻,最终将犯罪分子一网打尽。特侦组最终保护了人民群众和国家财产安全。。