本片的男主,鬼佛山(魔宗)培养多年的杀手,因善于御剑杀人,被称为“剑”。后遭遇搭档背叛与围剿,被心爱之人斩断手臂,身心俱残的剑开始自暴自弃,直至被女主一家人救下,剑逐渐被感化,并拥有了一个颇具浪漫色彩的名字——剑十二。东西冷战了170年后的未来,世界被分为东部和西部二个对立面。经常互相对峙,处于极度的紧张状态。在那样的状况中,设立了秘密谍报组织“Zero zero机关”,组织以00号码称呼着间谍部队中的人工控制机械人。
主人公ミレーヌ·ホフマン 属于00号码间谍“9小组”的女性人工控制机械人。代号009-1的她美丽的身体中包藏着许多秘密兵器,并赌上性命进行着谍报活动。。