故事发生在明朝末年,大将军戚继光和兵部尚书戚继宇联手组成戚家军,对胆敢侵犯国土的倭寇迎头痛击。倭寇首领大岛正雄和朝中司礼大太监童大宝(于承惠 饰)内外勾结,陷害戚继宇,导致戚家军解散,戚家遭到了满门抄斩,作为戚家唯一的后代,戚少正(吴京 饰)不得不踏上了逃亡的旅途。
少林寺方丈至一(王珏 饰)将戚少正收为徒弟,童大宝得知了戚少正的下落,火烧少林,至一为了保护戚少正不幸身亡。之后,戚少正带着至一的血书前往南少林投奔圆照方丈(徐向东 饰),并先后结识了小妮(法提麦·雅琦 饰)、红莲和华子等人。血气方刚的一行年轻人,打算凭借他们自己的力量,重建戚家军。。明末皇帝昏聩,庆王内外勾结密谋造反,护国密探罗冰拿到了关键证据被劫杀,身负重伤被梅香梅有凌母子所救。梅香为救罗冰而死。临死前,梅香告诉梅有凌他的生父是当今皇上,让梅有凌跟罗冰一起完成使命。 二人来到京城找到檀棋,希望她将证据转呈皇上。不料檀棋被李公公控制,联手裴琳欲杀二人。 还好二人早有准备,将裴琳引至树林生擒,并将裴琳师傅是西域蛊女何须女的真实身份告知。二人在另一位护国密探的陪同下夜闯皇宫面圣,被何女须抓住。裴琳与何须女有深处大恨,便决定帮助二人,共同商讨营救皇帝的对策。皇帝寿辰大宴群臣,庆王发难逼宫,何女须露出真面目,欲将群臣一网打尽 。最终国密探们阻止了何女须的计划。。