一个平凡的小山村,令人感动的故事时刻发生。面对这些孩子,乡村教师沈芳被他们的遭遇深深的触动,因此她决定帮助他们改变他们的命运。。位于东京的东都线地铁开通当日,一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件爆发,导致东都线列车损毁。经过一番推理,江户川柯南等人认定这次的事件与8年前朝仓优一郎主持负责的北之泽水坝的修建有关。
当年为了修建大坝,朝仓动员北之泽村的人民搬入新村,可是仍有许多人反抗到最后阶段不愿搬迁。为了探明事情的真相,柯南、灰原、少年侦探团以及毛利小五郎等人开车前往白雪皑皑的北之泽。在这片纯净的雪国,少年们尽情玩耍,与此同时他们也遇到了几名原北之泽村的村民,山尾、远野、立原等人。他们是从小一起长大的好朋友,而彼此之间似乎又有着某种芥蒂和秘密。
立原的儿子冬马在8年前坠崖,在这8年时间里他一直昏迷不醒。在母亲的照料下冬马终于醒了过来,但却丧失了记忆,不知道当时在自己身上发生了什么事情。柯南通过推理,认为冬马的坠崖与一系列的案件有关。。故事讲述的是在一座看似普通实则“暗流涌动”的边境小城,边防临时检查站站长何中华给即将高考的女儿打了电话,因为工作太忙一直没有很多时间陪伴女儿的何中华很愧疚,答应一定会陪女儿高考。挂断电话,何中华开始进入工作状态,例行边防检查,谁知这次过境的人是伪装起来的毒枭,双方在边境开火,何中华不幸中弹因公殉职。。